Index

B

base_compos() (in module telofinder.telofinder)

C

classify_telomere() (in module telofinder.telofinder)

compute_metrics() (in module telofinder.telofinder) count_polynuc_occurence() (in module telofinder.telofinder)

E

export_results() (in module telofinder.telofinder)

G

get_consecutive_groups() (in module telofinder.telofinder) get_entropy() (in module telofinder.telofinder)

get_polynuc() (in module telofinder.telofinder) get_strain_name() (in module telofinder.telofinder) get_telomere_in_telomeric_reads() (in module telofinder.telofinder)

M

module telofinder.telofinder

O

output_dir_exists() (in module telofinder.telofinder)

P

parse_arguments() (in module telofinder.telofinder)

R

run_on_fasta_dir() (in module telofinder.telofinder) run_on_single_fasta() (in module telofinder.telofinder)

run_on_single_seq() (in module telofinder.telofinder) run_telofinder() (in module telofinder.telofinder)

S

sliding_window() (in module telofinder.telofinder)

T

telofinder.telofinder module